Similar a muchas otras tribus de la amazonía, los Matsés practican la pintura corporal tradicional. El color rojo viene de un tinte natural obtenido de las semillas machacadas del árbol del achiote. Los Matses mezclarán a veces el achiote con la grasa animal y la mezcla que resulta es una pintura particularmente brillante para la cara. Además del achiote, los Matses utilizarán el huito (Genipa americana) como pintura negra. Utilizarán a veces el carbón de leña mojado para pintar sus cuerpos enteros resulta en un color azul-negro de la piel.